2000년대2000년대: 의과대학 40개2007년 한국의과대학·의학전문대학원장협회 명칭 변경주요사업: 법인화 추진, 리더십아카데미 운영, 기본의학평가 사업, CPX 공동 연구2008년 8월 26일 사단법인 한국의과대학·의학전문대학원장협회 설립초대 이사장: 임정기(서울의대) 목적 사업 ① 의과대학 및 의학전문대학원의 상호 교류, 협력에 관한 사업② 의학교육 제도 발전방안 발굴, 건의 및 의학교육 자료의 공유를 통해 의학교육 개선에 기여하는 사업③ 의학교육에 관한 국제 교류 사업기본의학교육평가컨소시엄 발족: 임상의학종합평가, 기초의학종합평가 시행
2010년대2012년 지정기부금 단체 승인의학교육혁신상 제정2013년 이사장: 강대희(서울의대)(사)한국의과대학·의학전문대학원협회 법인 명칭 변경회원 범위 확대 교육문화원, 정책연구소 설립 한국의과대학·의학전문대학원협회 30년사(각성과 도전) 발간KAMC 올해의 교수상, KAMC 이사장상 제정2016년 이사장: 한희철(고려의대)의학교육평가사업단 명칭 변경장기추적형 실습 (LIC, Longitudinal IntegratedClerkship) 컨소시엄 발족의과대학 학생평가 포트폴리오 컨소시엄 발족기본의학교육 데이터베이스 구축기본의학교육 졸업성과(KAMC Entrustable Professional Activities) 발간KAMC 코로나바이러스감염증-19 의과대학 대응지침 배포